Schránka může být zrušena pouze ministerstvem vnitra a to 3 roky po jejím zablokování. K zablokování může dojít z následujících důvodů: DS je zablokována z důvodu smrti fyzické osoby, prohlášení osoby za mrtvou, dále zániku právnické osoby, zániku organizace, nebo výmazem právnické osoby ze zákonem stanovené evidence.

